PD Dr. (Dipl.-Biol.) Jens Rudat
- Lehrbeauftragter
- Vorlesung BING-Biochemie, Industrielle Biokatalyse, Mikroskopie-Anleitung
- Gruppe:
- Sprechstunden:
nach Vereinbarung
- Raum: 118 in 30.44, 1. OG
- Tel.: +49 721 608-48428
- Fax: +49 721 608-44881
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Fritz-Haber-Weg 4, 76131 Karlsruhe
Publikationen
-
2024The Promising Role of Amine Transaminase Cascades in the Synthesis of Non-Canonical Amino Acids
Gord Noshahri, N.; Rudat, J.
2024. Processes, 12 (11), 2566. doi:10.3390/pr12112566Selective Peptide Binders to the Perfluorinated Sulfonic Acid Ionomer Nafion
Schmidt, D.; Gartner, P.; Berezkin, I.; Rudat, J.; Bilger, M.; Grünert, T.; Zimmerer, N.; Quarz, P.; Scharfer, P.; Brückel, J.; Jung, A. P.; Singh, P.; Pooja, P.; Meier, B.; Stahlberger, M.; Schabel, W.; Bräse, S.; Lanza, G.; Nesterov-Mueller, A.
2024. Advanced Functional Materials, 34 (20), Article no: 2214932. doi:10.1002/adfm.202214932 -
2023Enzyme Immobilization on Polypropylene Film: A Role Model for Biocatalytic Polymer Membranes?
Gartner, P.; Rudat, J.; Bilger, M.; Gruenert, T.; Lanza, G.
2023. Journal of Enzymes, 1 (3), 1–12. doi:10.14302/issn.2690-4829.jen-23-4799Development of two devices for high-throughput screening of ethanol-producing microorganisms by real-time CO₂ production monitoring
Gord Noshahri, N.; Sharifi, A.; Seyedabadi, M.; Rudat, J.; Zare Mehrjerdi, M.
2023. Bioprocess and Biosystems Engineering, 46 (8), 1209–1220. doi:10.1007/s00449-023-02892-3Self-healing Fuel Cells by Biological Actuators
Gartner, P.; Lanza, G.; Rudat, J.; Bilger, M.; Grünert, T.; Nesterov-Mueller, A.; Zimmerer, N.; Quarz, P.; Scharfer, P.; Schabel, W.; Jung, A. P.; Stahlberger, M.; Bräse, S.
2023. Procedia CIRP, 116, 161–166. doi:10.1016/j.procir.2023.02.028 -
2022Origin and Evolution of Enzymes with MIO Prosthetic Group: Microbial Coevolution After the Mass Extinction Event
Peng, F.; Engel, U.; Aliyu, H.; Rudat, J.
2022. Frontiers in Genetics, 13, Art.-Nr. 851738. doi:10.3389/fgene.2022.851738Enzymatic Synthesis of Alkyl Glucosides by β‐Glucosidases in a 2‐in‐1 Deep Eutectic Solvent System
Delavault, A.; Grüninger, J.; Kapp, D.; Hollenbach, R.; Rudat, J.; Ochsenreither, K.; Syldatk, C.
2022. Chemie - Ingenieur - Technik, 94 (3), 417–426. doi:10.1002/cite.202100150Enhanced Bioactivity of Tailor-Made Glycolipid Enriched Manuka Honey
Delavault, A.; Zoheir, A. E.; Muller, D.; Hollenbach, R.; Rabe, K. S.; Ochsenreither, K.; Rudat, J.; Syldatk, C.
2022. International Journal of Molecular Sciences, 23 (19), Art.-Nr.: 12031. doi:10.3390/ijms231912031Synthesis of (S)- and (R)-β-Tyrosine by Redesigned Phenylalanine Aminomutase
Peng, F.; Aliyu, H.; Delavault, A.; Engel, U.; Rudat, J.
2022. Catalysts, 12 (4), Art.-Nr.: 397. doi:10.3390/catal12040397 -
2021Biotechnologische Synthese und Transformation nicht-kanonischer Aminosäuren : neue Mikroorganismen und optimierte Enzyme - nachhaltige Substrate und effiziente (Hochdurchsatz-)Analytik - bioinformatorische Modellierung und innovative Produktionsverfahren. Habilitation
Rudat, J.
2021. Karlsruher Institut für Technologie (KIT)Alanins Wunderlampe : Vorkommen, Nutzung und Produktion nicht-kanonischer Aminosäuren
Rudat, J.; Engel, U.
2021. Biologie in unserer Zeit, 51 (4), 376–386. doi:10.11576/ biuz-4827Computational-designed enzyme for β-tyrosine production in lignin valorization
Peng, F.; Aliyu, H.; Delavault, A.; Engel, U.; Rudat, J.
2021. Catalysts, 11 (11), 1310. doi:10.3390/catal11111310Comparative study on interfacial and foaming properties of glycolipids in relation to the gas applied for foam generation
Hollenbach, R.; Oeppling, S.; Delavault, A.; Völp, A. R.; Willenbacher, N.; Rudat, J.; Ochsenreither, K.; Syldatk, C.
2021. RSC Advances, 11 (54), 34235–34244. doi:10.1039/D1RA06190AGrowth optimization and identification of an ω-transaminase by a novel native PAGE activity staining method in a Bacillus sp. strain BaH isolated from Iranian soil
Gord Noshahri, N.; Fooladi, J.; Engel, U.; Muller, D.; Kugel, M.; Gorenflo, P.; Syldatk, C.; Rudat, J.
2021. AMB Express, 11 (1), Art.-Nr.: 46. doi:10.1186/s13568-021-01207-7 -
2020Interfacial and Foaming Properties of Tailor-Made Glycolipids—Influence of the Hydrophilic Head Group and Functional Groups in the Hydrophobic Tail
Hollenbach, R.; Völp, A. R.; Höfert, L.; Rudat, J.; Ochsenreither, K.; Willenbacher, N.; Syldatk, C.
2020. Molecules, 25 (17), 3797. doi:10.3390/molecules25173797 -
2019Screening and comparative characterization of microorganisms from Iranian soil samples showing ω-transaminase activity toward a plethora of substrates
Noshahri, N. G.; Fooladi, J.; Syldatk, C.; Engel, U.; Heravi, M. M.; Mehrjerdi, M. Z.; Rudat, J.
2019. Catalysts, 9 (10), Article No.874. doi:10.3390/catal9100874 -
2018Improvement in the Thermostability of a β-Amino Acid Converting ω-Transaminase by Using FoldX
Buß, O.; Muller, D.; Jager, S.; Rudat, J.; Rabe, K. S.
2018. ChemBioChem, 19 (4), 379–387. doi:10.1002/cbic.201700467Enantiomer discrimination in β-phenylalanine degradation by a newly isolated Paraburkholderia strain BS115 and type strain PsJN
Buß, O.; Dold, S.-M.; Obermeier, P.; Litty, D.; Muller, D.; Grüninger, J.; Rudat, J.
2018. AMB express, 8 (1), Article: 149. doi:10.1186/s13568-018-0676-2β-Phenylalanine Ester Synthesis from Stable β-Keto Ester Substrate Using Engineered ω-Transaminases
Buß, O.; Voss, M.; Delavault, A.; Gorenflo, P.; Syldatk, C.; Bornscheuer, U.; Rudat, J.
2018. Molecules, 23 (5), Article: 1211. doi:10.3390/molecules23051211The ω-transaminase engineering database (oTAED) : A navigation tool in protein sequence and structure space
Buß, O.; Buchholz, P. C. F.; Gräff, M.; Klausmann, P.; Rudat, J.; Pleiss, J.
2018. Proteins, 86 (5), 566–580. doi:10.1002/prot.25477FoldX as Protein Engineering Tool: Better Than Random Based Approaches?
Buß, O.; Rudat, J.; Ochsenreither, K.
2018. Computational and structural biotechnology journal, 16, 25–33. doi:10.1016/j.csbj.2018.01.002 -
2017Toward a cell-free hydantoinase process : screening for expression optimization and one-step purification as well as immobilization of hydantoinase and carbamoylase
Slomka, C.; Späth, G. P.; Lemke, P.; Skoupi, M.; Niemeyer, C. M.; Syldatk, C.; Rudat, J.
2017. AMB express, 7 (1), Art. Nr. 122. doi:10.1186/s13568-017-0420-3Phenylalanine ammonia lyase from Arabidopsis thaliana (AtPAL2) : A potent MIO-enzyme for the synthesis of non-canonical aromatic alpha-amino acids. Part I: Comparative characterization to the enzymes from Petroselinum crispum (PcPAL1) and Rhodosporidium toruloides (RtPAL)
Dreßen, A.; Hilberath, T.; Mackfeld, U.; Billmeier, A.; Rudat, J.; Pohl, M.
2017. Journal of biotechnology, 258, 148–157. doi:10.1016/j.jbiotec.2017.04.005Phenylalanine ammonia lyase from Arabidopsis thaliana (AtPAL2) : A potent MIO-enzyme for the synthesis of non-canonical aromatic alpha-amino acids.. Part II: Application in different reactor concepts for the production of (S)-2-chloro-phenylalanine
Dreßen, A.; Hilberath, T.; Mackfeld, U.; Rudat, J.; Pohl, M.
2017. Journal of biotechnology, 258, 158–166. doi:10.1016/j.jbiotec.2017.04.035Hydantoinasen – von der präbiotischen Evolution zur Aminosäureproduktion
Rudat, J.; Engel, U.
2017. Biospektrum, 23 (1), 98–100. doi:10.1007/s12268-017-0770-z -
2016Transaminases and their applications
Dold, S.-M.; Syldatk, C.; Rudat, J.
2016. Green biocatalysis. Ed.: R. Patel, 715–746, Wiley-VCH Verlag. doi:10.1002/9781118828083.ch29One-step purification and immobilization of a β-amino acid aminotransferase using magnetic (M-PVA) beads
Dold, S.-M.; Cai, L.; Rudat, J.
2016. Engineering in life sciences / Special Issue: Molecular Interaction Engineering, 16 (6), 568–576. doi:10.1002/elsc.201600042Stereoselective synthesis of β-amino acids by hydrolysis of an aryl-substituted dihydropyrimidine by hydantoinases
Engel, U.; Syldatk, C.; Rudat, J.
2016. Practical Methods for Biocatalysis and Biotransformations 3. Ed.: J. Whittall, John Wiley and SonsStatistical Evaluation of HTS Assays for Enzymatic Hydrolysis of β-Keto Esters
Buß, O.; Jager, S.; Dold, S. M.; Zimmermann, S.; Hamacher, K.; Schmitz, K.; Rudat, J.
2016. PLoS one, 11 (1), e0146104. doi:10.1371/journal.pone.0146104 -
2015Chemical synthesis and enzymatic, stereoselective hydrolysis of a functionalized dihydropyrimidine for the synthesis of β-amino acids
Slomka, C.; Zhong, S.; Fellinger, A.; Engel, U.; Syldatk, C.; Bräse, S.; Rudat, J.
2015. AMB Express, 5 (1), 85. doi:10.1186/s13568-015-0174-8Hydrolysis of Hydantoins, Dihydropyrimidines, and Related Compounds
Slomka, C.; Engel, U.; Syldatk, C.; Rudat, J.
2015. Biocatalysis in Organic Synthesis 1. Ed.: K. Faber, 373–414, Thieme Gruppe -
2014The Hydantoinase Process: Recent developments for the production of non-canonical amino acids
Engel, U.; Rudat, J.; Syldatk, C.
2014. Industrial biocatalysis. Ed.: P. Grunwald, Chapter 22, 817–862, Pan Stanford PublCationic heterooligopeptides by ficain-catalyzed co-oligomerization of lysine and methionine ethylesters
Andre, M.; Kühl, B.; Brenner-Weiss, G.; Syldatk, C.; Rudat, J.
2014. Journal of peptide science, 20, 625–629. doi:10.1002/psc.2639 -
2013Enzymatical and microbial degradation of cyclic dipeptides (diketopiperazines)
Perzborn, M.; Syldatk, C.; Rudat, J.
2013. AMB Express, 3 (1), 12 S. doi:10.1186/2191-0855-3-51Separation of Cyclic Dipeptides (Diketopiperazines) from Their Corresponding Linear Dipeptides by RP-HPLC and Method Validation
Perzborn, M.; Syldatk, C.; Rudat, J.
2013. Chromatography research international, 2013, 310269. doi:10.1155/2013/310269 -
2012Transaminases for the synthesis of enantiopure beta-amino acids
Rudat, J.; Brucher, B.; Syldatk, C.
2012. AMB Express, 2 (1), 11. doi:10.1186/2191-0855-2-11Stereoselective hydrolysis of aryl-substituted dihydropyrimidines by hydantoinases
Engel, U.; Syldatk, C.; Rudat, J.
2012. Applied microbiology and biotechnology, 94 (5), 1221–1231. doi:10.1007/s00253-011-3691-7Novel amidases of two Aminobacter sp. strains: Biotransformation experiments and elucidation of gene sequences
Engel, U.; Syldatk, C.; Rudat, J.
2012. AMB express, 2 (1), 33. doi:10.1186/2191-0855-2-33 -
2011Food safety: Heat inactivation of Cronobacter in powdered infant formula
Baumann, S.; Rudat, J.
2011. International Journal of Medical Microbiology, 301, 59/1–1 -
2010Synthesis of aromatic beta-amino-acid with new cyclic amidases
Bretschneider, U.; Syldatk, C.; Rudat, J.
2010. Chemie Ingenieur Technik, 82 (1-2), 161–165Microbial conversion of B-Phenyl-alanine using new transaminase
Brucher, B.; Syldatk, C.; Rudat, J.
2010. Chemie Ingenieur Technik, 82, 155–160Enantioseparation of Aromatic beta(A3)-Amino acid by Precolumn Derivatization with o-Phthaldialdehyde and N-Isobutyryl-l-cysteine
Brucher, B.; Rudat, J.; Syldatk, C.; Vielhauer, O.
2010. Chromatographia, 71 (11-12), 1063–1067. doi:10.1365/s10337-010-1578-x
Curriculum vitae
Wissenschaftlicher Werdegang
| seit Feb 2022 | Privatdozent, venia legendi für das Fach "Technische Biologie" |
| seit Nov 2012 | Akademischer Rat am KIT-CS, Institut für Bio- und Lebensmitteltechnik, Bereich II: Technische Biologie |
| 2006 – 2012 | Gruppenleiter „Biokatalyse“ am KIT-CS (bis 2009 Uni Karlsruhe), IBLT_II: Technische Biologie |
| 2001 – 2006 | Promotion am Institut für Mikrobiologie & Biotechnologie der Universität Bonn bei PD Dr. René M. Fakoussa: Enzymatische Decarboxylierung von Benzenpolycarbonsäuren |
| 1995 – 2000 | Studium der Biologie (Diplom) an der Rheinischen Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn |
Auszeichnungen
3. Preis beim Innovationswetttbewerb NEULAND_2022 in der Kategorie "Ideenpreis" für das Projekt BioHealing - Selbstheilende Brennstoffzelle
Preis für exzellente Lehre in der Fakultät für Chemieingenieurwesen und Verfahrenstechnik des KIT (2012)
Stipendiat der Graduiertenförderung des Landes Nordrhein-Westfalen (Promotionsstipendium 2001-2003)
Forschungsinteressen
Biotransformation von Stickstoff-Heterozyklen (Hydantoine, Dihydropyrimidine, Diketopiperazine) sowie von kanonischen und nicht-kanonischen Aminosäuren, u.a. für halbsynthetische Penicilline.
Bakterieller Aromaten- und Stickstoff-Stoffwechsel.
Nutzung nachwachsender Rohstoffe zur Synthese von Feinchemikalien.
Molekularbiologische und verfahrenstechnische Optimierung von Enzymreaktionen: Genetic engineering, heterologe (Über-)Expression, verschiedene Immobilisierungsverfahren.
Internationale Forschungskooperationen
- 2008 – 2012 und 2016-2017 Mitglied des europäischen Förderprogramms COST in den Forschungsverbünden “CASCAT – Cascade chemo-enzymatic process“ sowie „Systems Biocatalysis“. Teilnahme an zwei COST-Sommerschulen und zahlreichen internationalen Workshops durch fünf Doktorand*innen der Gruppe.
- 2010 – 2015 Beteiligung an zwei Forschungskooperationen mit Südafrika (University of Cape Town und University of Western Cape); hierdurch mehrmonatiger Forschungsaufenthalt von sieben Mitarbeiter*innen des Lehrstuhls dort sowie Gegenbesuche südafrikanischer Wissenschaftler*innen.
- Seit WS 2016/17 Projektleiter einer Kooperation mit dem China Scholarship Council, darüber Betreuung einer chinesischen Doktorandin im Projekt LigArom
- WS 2018/19 Organisation und Betreuung eines Forschungsaufenthaltes einer Iranischen Gastwissenschaftlerin
Lehrtätigkeiten
Grundvorlesung „Biochemie“, Grundpraktikum „Biologie im Ingenieurwesen“ (Mikrobiologie), Hauptfachvorlesung und Seminar „Industrielle Biokatalyse“ für die Studiengänge Bioingenieurwesen, Chemieingenieurwesen, Biologie und Bioökonomie; Prüfungsberechtigung für Abschlussarbeiten in den genannten Studiengängen sowie im Lehramtsstudiengang Naturwissenschaft und Technik (NwT).
Öffentliche Vorträge, z.B. Karlsruher Nacht der Wissenschaft, Stuttgarter Wissenschaftsfestival, Akademie für Wissenschaftliche Weiterbildung (AWWK), Wissenschaft und Musik, Science Slam (1. Platz Microbe Slam 2018), KIT - Kinder-Uni
Sonstiges
Gutachtertätigkeit für die Zeitschriften Nature Communications, Applied Microbiology and Biotechnology, Biocatalysis and Biotransformation, Journal of Biotechnology, Molecules, Enzyme and Microbial Technology, Applied Biochemistry and Biotechnology, International Journal of Molecular Sciences sowie AMB Express.
Mitgliedschaft in der Vereinigung für Allgemeine und Angewandte Mikrobiologie VAAM sowie der DECHEMA Gesellschaft für Chemische Technik und Biotechnologie; Mitglied der Fachgruppen Biotransformationen und Weltraummikrobiologie.